Luis Milla kemudian kembali ke Spanyol pada akhir musim 2015, menandatangani kontrak sebagai pelatih kepala CD Lugo klub Segunda División dan mengundurkan diri pada akhir Februari 2016.
Pada musim berikutnya, dalam kapasitas yang sama, ia bergabung dengan Zaragoza dan berakhir dipecat setelah hanya empat bulan bertugas dan enam pertandingan tanpa kemenangan.
Pada 21 Januari 2017 memimpin tim nasional Indonesia dengan menandatangani kontrak dua tahun.
Pada Oktober 2018, kontraknya tak diperpanjang oleh Persatuan Sepak Bola Indonesia. (*)